RNA测序(RNAsequencing,简称RNA-Seq)技术,作为一种高通量测序技术,在过去的十年中迅速发展,成为了转录组水平上分析差异基因表达和mRNA可变剪切的不可或缺工具。RNA-Seq技术通过对mRNA、smallRNA、noncodingRNA等RNA分子的表达水平进行定量分析,为我们揭示了生命活动的奥秘。
1.RNA-seq技术RNA-seq技术利用高通量测序技术对RNA分子进行测序分析,从而反映出mRNA、smallRNA、noncodingRNA等或其中一些的表达水平。这一技术具有高灵敏度、高准确性和高通量的特点,已成为转录组研究的重要手段。
2.RNA直接测序与多维度信息检测RNA直接测序技术(RNAdirectsequencing,简称DRS)能够同时检测多维度信息。例如,通过DRS技术,研究者可以鉴定m6A单碱基位点、isoform可变剪切位点、isoform定量和isoform与参考基因组比对结果。这一技术为RNA修饰位点鉴定及表达水平分析提供了有力支持。
3.单细胞测序与RNA-seq技术单细胞测序(single-cellsequencing)作为近年来生物科研领域的明星,以其革命性的影响力,成为研究者们关注的热点。在单细胞水平上,RNA-seq技术可以更准确地分析单个细胞内的RNA表达水平,为细胞异质性研究提供有力工具。
4.转录组测序与mRNA/lncRNA分析转录组测序主要针对线性的mRNA以及lncRNA(长非编码RNA)。其基本流程包括RNA提取、RNA建库、高通量测序和数据分析等步骤。通过转录组测序,研究者可以全面了解基因表达水平,为基因功能研究提供重要线索。
5.小RNA测序与表观遗传学研究小RNA测序主要针对18~40个nt的小分子RNA,如miRNA、snoRNA等。在进行小RNA测序前,需要通过片段选择等方法构建文库。小RNA测序技术在表观遗传学研究方面具有重要意义,有助于揭示基因表达的调控机制。
6.RNA甲基化测序与CircRNA测序上海云序生物科技有限公司专注于RNA甲基化测序、CircRNA测序、环状RNA测序、MeRI测序等服务。这些技术有助于研究RNA分子的表观遗传学调控,揭示基因表达调控网络。
7.绝对定量RNA测序技术云序生物的绝对定量RNA测序技术(UMI+sike-in)通过引入分子标记和sike-in控制组,实现RNA分子表达的绝对定量。这一技术为RNA表达水平分析提供了更准确的数据支持。
RNA测序技术在生物科研领域具有广泛的应用前景,有助于揭示生命活动的奥秘。随着技术的不断发展,RNA测序将在未来发挥更加重要的作用。